諸尊各有根本之印與明。秘藏記私鈔六曰：「諸尊各有根本印明，秘經說愛染王法，誦大根本明（云云）。不動亦有根本印明，三摩地儀軌云：即結根本印，誦本明七徧（云云），是說大日根本印明也。如此一一尊各有本印本明。」 或為堅實合掌，或為智拳印。此中以智拳印習為灌頂之秘密印。
一根本印 密教之諸尊均有其根本之印與明，而以之為彼等內證本誓之標幟。印者印契，明者陀羅尼。諸尊之印明通常有三種，即根本印、心祕密印、隨心印等，與之相應之陀羅尼為根本陀羅尼（大心咒）、心真言、心中心真言（隨心咒）；例如如意輪儀軌所說之如意輪根本印真言、十一面儀軌經中所說之十一面觀自在根本印真言等均屬此類。〔祕藏記私鈔卷六〕p5206
諸佛各有其根本之印與明。